по популярности / по алфавиту

эксперт

Китай хакнул американский рынок высоких технологий

«Китайские инвесторы теряют доверие к своей экономике и инвестируют в высокие технологии за рубежом»

подробнее

Российский банк-депозитарий сохранит биоразнообразие планеты

Автор:

Дата: 13 февраля 2017 9:45

Исследователи из Московского государственного университета запустили национальный банк-депозитарий живых систем. Проект «Ноев ковчег», посвященный созданию многофункционального сетевого хранилища биологического материала, позволит сохранить биоразнообразие планеты.

Основной задачей проекта «Ноев ковчег», по словам научного координатора проекта, ведущего научного сотрудника Московского университета Петра Каменского, является сохранение, исследование и полезное использование биологического разнообразия нашей планеты. «В рамках «Ноева ковчега» мы работаем со всеми возможными типами биологических образцов, от засушенных насекомых до клеток и целых органов человека, — объясняет Каменский. — Важная часть проекта – создание единого биоколлекционного информационного пространства. Иными словами, мы разрабатываем цифровой ресурс, который объединит в себе максимум возможной информации о биологических коллекциях».

Ситник сплюснутый.
Берёза карликовая.
Зюзник европейский.
Пальчатокоренник Траунштейнера.
Зубровка альпийская.
Лиственница сибирская.
Щучка северная.

Ученые МГУ создают для каждого образца из коллекций подробные паспорта, содержащие информацию о каждом из организмов. Важно не только присутствие образца в коллекции, но и его подробное описание: что за организм, кем, где и когда он был собран, чем примечателен и для чего его можно использовать в науке и практике. Все изображения представлены в высоком разрешении так, чтобы на одном снимке можно было подробно изучить отдельные фрагменты образца.

Важной функцией системы является возможность автоматической загрузки уже известных сведений о хранящихся организмах из авторитетных международных баз данных, таких как Catalog of Life, NCBI GenBank и другие. Таким образом, паспорт образца может содержать самую разнообразную информацию, вплоть до последовательности генома организма. Все образцы имеют уникальный штрих-код, который позволяет находить всю введенную в систему информацию при помощи смартфона.

Пока самой масштабной частью базы является коллекция отсканированных изображений образцов из фондов биологического факультета. Гербарий Московского университета – один из ведущих центров изучения и документации разнообразия растений. Первое упоминание о нем относится еще к 1780 году, сейчас же он представляет собой коллекцию мирового значения, с объемом фондов более миллиона образцов. Здесь сосредоточены как ценнейшие исторические реликвии, связанные с именами Карла Линнея и Джеймса Кука, так и обширные материалы последующих исследователей флоры. В коллекции Гербария хранится много образцов, по которым были описаны виды. Такие образцы называются типовыми или голотипами.

Миллионный образец гербария Московского университета.

На 13 февраля 2017 года в базе данных растений представлено 501 892 объекта, микроорганизмов и грибов – 12 274. К 2018 году ученые планируют загрузить в систему все образцы, которые есть в коллекциях МГУ. Но уже сейчас Депозитарий живых систем МГУ занимает первое место в мире по числу отсканированных образцов среди университетских коллекций и шестое место среди всех аналогичных хранилищ, уступая лишь собраниям в Париже, Лейдене, Пекине, Нью-Йорке и Вашингтоне. Актуальная версия системы доступна всем желающим.

Разработчики планируют расширять базу не только за счет коллекций МГУ, но и других научных организаций. Система разработана с расчетом на то, что она сможет объединить в одном информационном поле все российские биоколлекции.

Представленные в системе данные и организмы уже активно используются в работе учеными, что отражено в опубликованных ими статьях, последние из которых вышли в журналах Molecular Phylogenetics and EvolutionPLOS ONE и Photosynthesis Research.

Впрочем, простым людям воспользоваться онлайн-базой довольно сложно. При поиске необходимо ввести латинское название или воспользоваться функцией расширенного поиска. Поиск и выдача происходят медленно, поэтому натуралистам следует запастись терпением, ожидая обновления страницы поискового запроса.

Понравилась заметка? Поделитесь —

Комментарии (0)

Добавить комментарий

Войти с помощью: